1. Sekretariat Jenderal;
2. Direktorat Jenderal Pembangunan Desa dan Perdesaan;
3. Direktorat Jenderal Pengembangan Ekonomi dan Investasi Desa dan Daerah Tertinggal
4. Direktorat Jenderal Percepatan Pembangunan Daerah Tertinggal;
5. Inspektorat Jenderal;
6. Badan Pengembangan dan Informasi Desa dan Daerah Tertinggal;
7. Badan Pengembangan Sumber Daya Manusia dan Pemberdayaan Masyarakat Desa dan Daerah Tertinggal;